曲煥章在行醫過程注重探索各種草藥配製之後的變化與用途，勇於創新。他既注意學習和繼承中國的傳統醫學知識，又重視博采眾長，遍嚐上百種草藥，經過多年的的反複試製、改進和驗證，於1902年創製出對治療跌打損傷、內髒出血有奇特功效的雲南白藥（百寶丹）。

1933年，“曲煥章大藥房”於昆明金碧路建造落成，開始規模化生產和銷售曲煥章萬應百寶丹。藥房落成各界名流均送匾題詞。雲南省主席龍雲贈“針膏起疾”匾，國民黨元老胡漢明贈“白藥如神”匾。

1938年，雲南58、60軍北上抗日，曲煥章滿腔愛國熱血沸騰難抑，主動捐獻3萬瓶萬應百寶丹給抗日官兵。3月，李宗仁親率川、滇、魯諸軍，在台兒莊與日軍浴血奮戰，一舉斃敵兩萬餘人。白藥因藥效如神，作為滇軍的“隨身三件寶”之一，滇軍神威也令白藥名聲大振，為抗日戰爭做出了卓越的貢獻。在抗日戰爭時期，白藥供不應求，在國內暢銷，並遠銷港澳、新加坡、雅加達、馬來西亞、泰國等地，

1955年10月，繆蘭瑛由衷的感謝共產黨和政府的關懷和照顧，並為了使百寶丹有更大的發展，更好的為人民服務，繆蘭瑛將“曲煥章萬應百寶丹”處方和技術全部貢獻給國家。10月，經昆明市人民政府衛生局批準，將原曲煥章大藥房庫存藥品、藥材、物資等作價收買劃歸國營昆明市製藥廠，“曲煥章萬應百寶丹”改名為“雲南白藥”，由地方國營昆明市製藥廠正式生產，確定了白藥生產的工藝和質量標準，任命繆蘭瑛為技師，負責白藥生產的技術指導，並動工興建白藥車間。

1956年1月23日昆明市製藥廠申請生產“雲南白藥”，經昆明市衛生局（56）醫字159號批準，1956年2月昆明市製藥廠五車間開始正式生產雲南白藥。

1970年6月，周恩來總理對雲南白藥的生產情況相當關心，並做了三條重要指示：一、建立一個生產雲南白藥的專廠；二、對雲南白藥建立專門的研究機構；三、建立雲南白藥原料的生產基地。

1971年5月20日，雲南省燃料化學工業局革命委員會（71）雲燃化革政字第29號文批準成立雲南白藥廠革命委員會。

1993年5月雲南省體製改革委員會雲體改[1993]48號文同意成立雲南白藥實業股份有限公司，11月6日—9日“雲白藥”順利發行，同期“雲白藥”在深圳證券交易所掛牌上市，成為雲南省第一家上市公司。

1996年11月雲南省經濟體製改革委員會雲體改複[1996]48號文同意組建雲南白藥集團股份有限公司，以現金形式出資，對大理製藥廠、文山州製藥廠、麗江藥業有限公司三家企業進行控股，實行母子公司管理體製的企業法人聯合體，實現了雲南白藥的“五統一”（統一生產計劃、統一商標、統一批準文號、統一質量管理、統一銷售），實現了雲南白藥的獨家生產經營。

1999年12月雲南白藥集團出資3000萬元組建雲南白藥集團醫藥電子商務有限公司，標誌著營銷工作的創新改造開始啟動，

2011年10月，雲南白藥從生產了40年的昆明51號正式轉場至呈貢區，整體搬遷項目的實施，促進了公司的產業升級、管理升級和服務升級。2011年12月，“雲南白藥產業基地落成典禮”成功舉辦，揭開了雲南白藥新的發展篇章。雲南省委省政府領導親臨現場，對企業10餘年的持續、快度發展給予了充分的肯定，鼓勵雲南白藥通過“新白藥、大健康”戰略的實施，為雲南省生物醫藥經濟的發展探索新的發展路徑，省委、省政府將將一如既往支持、扶持、培育雲南白藥。

2016年12月，為全麵深化國企改革，推進企業混合所有製改革試點，快速做強、做優、做大雲南白藥，雲南省國資委、新華都實業集團股份有限公司、雲南白藥控股有限公司在昆明舉行了合作協議簽字儀式，擬通過完全增資的形式引入新華都實業集團股份有限公司作為雲南白藥控股有限公司的戰略投資人。

2019年，雲南白藥集團完成吸收合並雲南白藥控股。雲南白藥通過發行股份的方式對白藥控股實施吸收合並。雲南白藥為吸收合並方，白藥控股為被吸收合並方。本次吸收合並完成後，雲南白藥為存續方，將承繼及承接白藥控股的全部資產、負債、合同及其他一切權利與義務，白藥控股將注銷法人資格；白藥控股持有的上市公司股份將被注銷，雲南省國資委、新華都及江蘇魚躍將成為上市公司的股東。